一、以新的机制模式在全国率先推进农业前沿技术创新
北京科技工作围绕农业生物技术、农业育种、农业投入品等几大关键领域，不断探索新的机制和模式，开展前沿技术创新，做足农业技术储备。
率先建立新型的农业育种研发平台。北京市于2005年在全国率先建立了开放性的农业育种基础研究创新平台，改变初步以往基础研究与生产分离、科技力量分散、学科领域之间交叉少的农业育种研发模式。目前平台集合了国内外56个单位，聚集了包括7位院士在内的国内外450名高水平专家，共同对重大基础理论和关键技术进行攻关。
率先建立农业生物技术孵化器。北京市建立了植物分子育种前沿技术联合实验室和农业生物技术孵化器，把转基因技术和分子设计等分子生物学手段应用于植物的遗传育种，并为研发单位提供实验、展示基地，推动传统 “常规育种”向高效 “精确育种”转变，提升北京地区农作物分子育种研发水平。
率先攻关新型农业投入品。北京市依托市属及中央在京科技资源，引进、消化和吸引国际领先的技术和资源，以重大项目的形式，在生防制剂、新型肥料、畜禽疫苗的研发及产业化开发等方面开展了重点攻关。其中，在全国率先开展树脂包膜肥料的研发攻关，并率先实现了产业化。
二、以新的组织方式推进农业实用技术推广
北京市科委积极探索新的组织方式，结合需求分析与技术选择，以籽种产业为龙头，推进农业实用技术推广，带动设施农业、休闲农业等相关产业的发展。
实施一批重大攻关工程。结合农业发展需求，开展籽种产业科技支撑工程、精准农业应用技术开发与应用、设施蔬菜高效生产技术集成应用、果品保鲜与加工的冰温技术应用等系列应用技术攻关。其中，为促进首都籽种产业的发展，多方社会力量参与，研发、生产、交易并进，形成研发、生产、交易“三位一体”的籽种产业体系。
建设一批现代农业示范基地。为建设有特色的首都现代农业经济，自2002年开始北京建设了顺义三高农业科技示范园、小汤山现代农业科技示范园等一批示范基地。其中，三高园区在三个方面为国内农业园区起到了示范带动作用，一是建立了符合市场经济要求的园区经营管理机制；二是建立了园区主导的农民专业合作组织体系，开创了农业园区与农民专业合作组织联合的先河；三是形成了一批在全国有影响的农业产业化项目。
培养一批区域主导产业。在组织科研部门开展资源底牌调查和区县需求调研的基础上，按需求导向的工作原则，依托首都科技资源，按一区一品的布局，以重大项目的形式支持平谷大桃、怀柔板栗、丰台花卉、大兴梨、房山食用菌、昌平苹果等产业的发展，培养区域主导产业。
推广一批先进实用技术。为科技资源优势转化为农业发展强势，实施了奶牛良种换代工程、蛋种鸡推广工程、玉米雨养旱作节水科技推广工程、蔬菜新品种更新换代工程等多个重大项目，推广先进实用的新品种、新技术。其中蛋种鸡推广工程创造出由政府扶持、农村合作组织投资建设、龙头企业(华都集团峪口禽业公司)经营管理的“产权式农业”模式 ，推广具有自主知识产权的蛋种鸡，带动农民致富。
三、以新的发展理念推进新型农村科技服务体系建设
近年来，北京市科委积极构建以农村科技协调员为核心，以“市场化、信息化、乡土化、社会化”为特征的新型农村科技服务体系，推动农业新技术、新成果的应用推广，提高农民的组织化程度、科技素质和增收致富能力。
让农民服务农民。培养一支来自农民、植根农民、服务农民的农村科技协调员队伍，培养农村自己的“科技二传手”，打破科技成果推广的城乡二元结构，促使科技成果“一步迈入”农民手中。
引入市场化社会化机制。一方面强调发挥市场对资源配置的基础性作用，另一方面通过经济杠杆调动各方积极性，构建利益共同体，形成互利共赢的发展格局。多元主体服务于市场，又获利于市场，表现出强大的生命力和良好的发展前景。
突破资源输入瓶颈。北京市科委和北京市农科院联合打造农村科技服务港和爱农信息驿站等科技服务平台，上联高校院所，下接“三农”需求，成为城乡科技交流互动的畅通、稳定的渠道，成为农村科技协调员的强大后盾。
强化信息服务手段。北京市科委通过组织实施农村信息化Ⅰ期、Ⅱ期和Ⅲ期工程，改善了农村信息基础设施条件，在信息服务中不再单纯着眼于技术推广，拓展了信息服务的领域和范围，为京郊农民提供从生产到经营、从学习到生活、从工作到精神文化的全方位快捷服务，为实现助农、富农、乐农、便农的发展目标提供了有效支持。
四、以新的产学研结合方式构建农业科技创新体系
北京市科委以深化科技管理改革为突破口，积极引导全社会创新资源按市场经济规律提高配置效率，推动院所科技体制改革，力促企业成为创新主体。
推动农业科研院所科技体制改革。北京市科委探索建立公益性科研成果产业化机制和农业科研院所改革模式。其中，针对北京市农科院畜牧所掌握多项畜禽疫苗技术成果，却举步维艰、无法做大做强的状况，北京市科委组织了“禽用疫苗工艺研究及产业化”项目，明确要求以实现疫苗产业化带动畜牧所改革。通过开展科技资源招商，北京市农科院畜牧所的疫苗专利、技术人才优势与疫苗生产企业山东信得药业公司的市场营销优势结合，实现强强联姻，组建全新的公司。目前，该科技公司禽用疫苗年生产能力达65亿羽，年产值超过1亿元，年创利润1800万元。
力促企业成为创新主体。北京市科委支持企业创新发展的科技项目不仅“输血”，而且“造血”，通过建立“科技研发——成果转化——占有市场”的创新机制，解决科技研发与生产和市场脱节的难题，变“研用错位”为“研用结合”。其中，北京市科委指导华都兽医生物药品厂创新研发机制，不从零开始做研发，而是通过直接购买科研专利成果、合作研发、自主研发、科技成果入股等多种形式，快速获得有市场前景的畜禽生物新药的研发成果；同时，利用既有的生产能力，快速把成果形成新产品推向市场。企业的利润在三年内提高了18倍。
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